El Viceministerio de Justicia y del Derecho en desarrollo de las funciones establecidas en la Ley 489 de 1998 y el Decreto 4530 de 1998 se encarga de coordinar y desarrollar de manera armónica las estrategias, la gestión y la política pública del Sector Justicia en el Ejecutivo, que está conformado en el Ministerio por las siguientes Direcciones:

1. Dirección de Acceso a la Justicia.
2. Dirección de Justicia Formal y del Derecho.
3. Dirección de Justicia Transicional.
4. Dirección de Ordenamiento Jurídico.
5. Dirección de Defensa Jurídica del Estado.
6. Dirección de Política Criminal y Penitenciaria.
7. Dirección de Política de Lucha contra las Drogas y Actividades Relacionadas.

Adicionalmente, en el orden descentralizado se encuentran las siguientes entidades adscritas o viculadas:

1. Instituto Nacional Penitenciario y Carcelario - INPEC
2. Dirección Nacional de Estupefacientes - DNE
3. Superintendencia de Notariado y Registro - SNR
4.Imprenta Nacional de Colombia - IMPRENTA